Remastersys, haz tu propia distro.

He estado probando esta aplicación en Linux Mint LXDE con unos resultados asombrosos, podemos crear una imagen iso que permite instalar tu sistema de escritorio modificado a tu gusto, con tu configuración y paquetes instalados creando por ejemplo una variante de Linux Mint perfectamente instalable y que se puede meter en un pendrive o dvd sin problemas.
También sirve para crear un Backup de tu sistema y restaurarlo luego fácilmente.